本課程之開設主要是介紹當代應用生化學裡最主要的課題: 包括基礎的蛋白質一級結構、氨基酸結構、胜?二級、二級結構、超二級結構、蛋白質三級結構、蛋白質四級結構、蛋白質功能、蛋白質構形、蛋白質分子模擬、酵素結構與催化動力學、酵素與電化學晶片、抗體結構與功能、抗體抗原間相互作用化學動力學、親和性生物感測晶片、蛋白質電泳晶片、蛋白構形形變量測、奈米粒子蛋白質修飾技術、蛋白質奈米流體力學、胜?奈米彈簧、抗體抗原間相互作用力學、DNA一級結構、DNA螺旋結構、DNA構形、基因感測晶片、DNA微陣列、DNA與光電力、DNA蛋白質與全反射螢光顯微術單分子偵測、掃描穿隧顯微術、蛋白質DNA表面奈米電繪製、原子力顯微術、蛋白質DNA分子薄膜奈米感測器、蛋白質奈米馬達、奈米生物機器人、蛋白質lithography、醣類結構與功能、醣類晶片，脂肪結構與功能、脂肪奈米力學等等作為修課學生在將來奈米醫學與奈米力學之研究和應用奠定傑出的基礎。